如果二人做生意账目不清，但经双方协商分清并达成协议后，通常是不能再起诉的。以下是对此问题的详细分析：

一. 账目不清达成协议后的法律效果

1. 协议的法律效力：当二人因账目不清产生争议后，通过协商达成一致并签订协议，该协议在法律上通常具有约束力。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，自成立时生效，对当事人具有法律约束力。

2. 争议的解决：一旦双方就账目问题达成协议，意味着双方已经就争议事项达成了和解。在协议得到有效履行的情况下，原争议即告解决，双方不再享有因原争议而产生的诉权。

二. 起诉的条件与限制

1. 起诉的条件：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十九条，起诉必须符合下列条件：

   • 原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
   • 有明确的被告；
   • 有具体的诉讼请求和事实、理由；
   • 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。

在账目已经分清并达成协议的情况下，双方之间的争议已经得到解决，通常不再满足上述起诉条件中的“有具体的诉讼请求和事实、理由”这一要求。

1. 诉讼的诚信原则：在民事诉讼中，当事人应当遵循诚实信用原则。如果双方已经就账目问题达成协议并履行完毕，而后又提起诉讼，可能构成对诚信原则的违反，法院可能会因此驳回起诉。

三. 特殊情况考虑

• 协议的无效或可撤销：如果双方达成的协议存在无效或可撤销的情形，如欺诈、胁迫、重大误解等，受损方仍然有权依法提起诉讼，请求法院确认协议无效或撤销协议。但在此情况下，诉讼的请求和理由将不再是原账目不清的争议，而是关于协议效力的问题。

我的观点：在一般情况下，如果二人因做生意账目不清产生争议，但经双方协商分清并达成协议后，是不能再起诉的。因为协议已经对原争议事项进行了解决，双方应当遵循协议的约定履行各自的义务。然而，如果协议存在无效或可撤销的情形，受损方仍然有权依法提起诉讼。如有进一步需要，您可以继续咨询我。