针对您提出的“买卖合同纠纷中，同样的原被告，两份不同的供货合同最后结算在一起，是分两个案件起诉还是合并起诉”的问题，我给出如下分析：

结论：是否分两个案件起诉，取决于两份供货合同之间的关联性、独立性以及诉讼的便利性和效率性。一般情况下，如果两份合同相互独立，且分别结算，则可能分两个案件起诉；但如果两份合同在履行过程中存在高度关联，且结算时也是作为一个整体来处理，则可以考虑合并起诉。

分析说明：

1. 合同独立性：首先，需要判断两份供货合同在内容上是否相互独立。如果两份合同分别约定了不同的供货品种、数量、价格、交货时间等条款，且各自独立履行，那么它们就是两个独立的合同关系，原则上可以分两个案件起诉。

2. 结算关联性：其次，要看两份合同的结算是否关联。虽然您提到两份合同最后结算在一起，但这并不必然意味着它们必须合并起诉。如果结算只是出于财务上的便利，而两份合同的履行情况、争议焦点等各不相同，那么仍然可以分两个案件处理。

3. 诉讼便利性和效率性：最后，还需要考虑诉讼的便利性和效率性。如果合并起诉能够简化诉讼程序，减少当事人的诉累，提高审判效率，那么合并起诉是可取的。但如果合并起诉会导致诉讼程序复杂化，或者增加当事人的诉讼负担，那么分两个案件起诉可能更为合适。

法律建议：

• 在决定是否分两个案件起诉时，建议您仔细审查两份供货合同的具体内容，包括合同条款、履行情况、争议焦点等方面，以判断它们之间的关联性和独立性。
• 如果两份合同在履行过程中存在高度关联，且结算时也是作为一个整体来处理，您可以考虑向法院提出合并起诉的申请，并说明合并起诉的理由和依据。
• 如果两份合同相互独立，且分别结算，那么您可以分别向法院提起诉讼，并分别陈述各自的事实和理由。

总之，在处理此类问题时，需要根据具体情况进行综合考虑和判断。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。