扣工资百分之40的计算方法如下：

1. 基础计算法：

   • 假设原工资为X元。
   • 扣除的工资数额为X × 40% = 0.4X元。
   • 实际发放的工资为X - 0.4X = 0.6X元。
   • 举例：若月工资为6000元，则扣除的工资为6000 × 40% = 2400元，实际发放工资为6000 - 2400 = 3600元。

2. 简捷计算法：

   • 直接将原工资乘以60%（因为100% - 40% = 60%），即可得出扣除40%后的工资。
   • 举例：若月工资为6000元，则直接计算6000 × 60% = 3600元，即为扣除40%后的工资。

法律分析与提醒：

• 根据《工资支付暂行规定》，用人单位在特定情况下（如劳动者造成经济损失）可要求劳动者赔偿，并从其工资中扣除，但扣除额度有限制，一般不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
• 因此，如果用人单位无故扣除员工工资40%，很可能构成违法克扣。
• 劳动者发现自己的工资被无故扣除时，有权通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。

我建议：用人单位在扣除员工工资前应仔细审查相关法律规定和劳动合同约定，确保扣除行为的合法性。同时，劳动者也应了解自己的工资权益，对于违法扣工资行为要及时采取措施维护自身合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。