扣全勤工资的计算方式需根据具体情形确定，但核心原则是：用人单位不得随意扣除，必须符合法律规定或劳动合同约定。具体分析如下：

1. 若劳动合同或规章制度明确约定全勤奖条件及扣除规则
   例如：约定“员工当月无迟到、早退、旷工、请假（病假/事假除外）可获全勤奖500元，缺勤1天扣20%”。

   • 合法性前提：制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
     
   • 计算方式：按约定比例扣除，如缺勤1天扣20%（即100元），剩余400元可发放。

2. 若未约定全勤奖规则，用人单位单方扣除可能违法

   • 法律依据：根据《工资支付暂行规定》，用人单位不得克扣劳动者工资，除非因劳动者原因造成经济损失且经协商一致。
     
   • 风险点：若用人单位以“未全勤”为由直接扣发工资（非奖金），可能被认定为未足额支付劳动报酬，劳动者可要求补发并主张经济补偿。

3. 特殊情形：病假、事假、旷工的扣除规则

   • 病假：需提供医疗证明，扣除部分应符合地方规定（如北京允许按不低于最低工资80%支付病假工资，全勤奖可能不扣）。
     
   • 事假：用人单位可扣除当日工资，但全勤奖扣除需有约定支持。
     
   • 旷工：除扣除当日工资外，若规章制度明确旷工影响全勤奖，可按约定扣除。

建议行动：

• 核对劳动合同、员工手册中关于全勤奖的条款；
  
• 若用人单位违法扣除，可先协商，协商不成可向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁；
  
• 保留考勤记录、工资条等证据，以便维权。
  

如有进一步细节（如具体扣除比例、地方政策差异等），可继续向我咨询。