在劳动仲裁中，被告公司一般不可以直接申请调查微信转账记录。下面我将从几个方面详细解释这个问题：

1. 证据收集与申请调查的主体：

   • 在劳动仲裁中，证据的收集通常由当事人（即劳动者或公司）自行进行，并自行向仲裁庭提交。
   • 如果公司需要微信转账记录作为证据，应当自行通过合法途径获取，比如从公司财务记录、银行转账记录等渠道查找，而不是直接申请仲裁庭去调查。

2. 微信转账记录的合法性与证明力：

   • 微信转账记录作为电子数据，其合法性取决于其是否真实、完整且未经篡改。
   • 如果公司能够提供合法、有效的微信转账记录，并且这些记录与劳动仲裁案件有直接关联，那么它们将具有相应的证明力。

3. 仲裁庭的调查权：

   • 仲裁庭在劳动仲裁过程中有一定的调查权，但这种调查权通常是在当事人提出申请，并且仲裁庭认为有必要的情况下才会行使。
   • 仲裁庭的调查主要集中在案件事实、证据的真实性、合法性以及关联性等方面，而不是直接为当事人收集证据。

4. 建议与注意事项：

   • 如果公司确实需要微信转账记录作为证据，建议首先尝试从公司内部或相关金融机构获取这些记录。
   • 如果无法自行获取，可以考虑向仲裁庭提出申请，请求仲裁庭协助调查或要求对方当事人提供。但这种情况下，公司需要提供充分的理由和证据来支持其申请。
   • 在整个过程中，公司应当确保所收集的证据合法、有效，并且与劳动仲裁案件有直接关联。

综上所述，被告公司在劳动仲裁中一般不可以直接申请调查微信转账记录。如果确实需要这些记录作为证据，应当通过合法途径自行获取，并在必要时向仲裁庭提出申请。