铁路工程施工中工作断断续续，一般不会影响工伤的认定。工伤的认定主要基于是否在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或者是否因履行工作职责受到暴力等意外伤害，以及是否患有职业病等，与工作的连续性没有直接关系。
具体来说：
工伤认定的核心要素：
- 工作时间和工作场所：事故是否发生在工作时间和工作场所内，这是认定工伤的基本条件。
- 工作原因：事故是否因工作原因引起，即伤害是否与工作职责有关。
- 职业病：是否因接触职业病危害因素而患职业病。
工作断断续续的影响：
- 工作断断续续本身并不直接决定是否能认定为工伤。关键在于伤害发生时，是否满足上述工伤认定的核心要素。
- 如果工作断断续续是由于工程进度的需要、天气原因、设备维护等正常因素导致的，并且伤害发生在工作时间和工作场所内，因工作原因引起，那么仍然可以认定为工伤。
特殊情况：
- 如果工作断断续续是由于员工个人原因（如无故旷工、擅自离岗等）导致的，并且伤害发生在非工作时间或非工作场所内，那么这种情况可能不会被认定为工伤。
因此，在铁路工程施工中，即使工作断断续续，只要伤害满足工伤认定的核心要素，就有可能被认定为工伤。如果您在具体案件中遇到此类问题，建议详细咨询当地社会保险行政部门或专业律师，以便获得更准确的法律意见。