病历中没有会诊邀请函，但司法鉴定机构的鉴定仍然有效。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 病历与司法鉴定的关系

1. 病历的作用：病历是医疗过程中形成的记录，用于反映患者的病情、治疗经过及医生的诊断等。它主要作为医疗行为的证据，但在法律上，并非所有医疗纠纷的解决都完全依赖于病历。
2. 司法鉴定的独立性：司法鉴定是由具有专业资质的鉴定机构，依据相关法律法规和科学技术手段，对涉及诉讼的专门性问题进行检验、鉴别和判断的活动。其鉴定结论具有法律效力，独立于病历存在。

二. 会诊邀请函的缺失对司法鉴定的影响

1. 会诊邀请函的性质：会诊邀请函通常是医疗机构之间或医生之间，为就某一疑难病例进行会诊而发出的邀请。它并非医疗纠纷解决的必要证据，也不是司法鉴定的前置条件。
2. 鉴定的有效性：司法鉴定机构在鉴定过程中，会综合考虑病历、患者陈述、医生证言等多种证据材料。即使病历中缺失会诊邀请函，只要其他证据充分，鉴定机构仍然可以作出有效的鉴定结论。

三. 法律依据

• 根据《司法鉴定程序通则》的相关规定，司法鉴定机构应当独立、客观、公正地进行鉴定，不受任何单位和个人的干涉。这保证了司法鉴定的独立性和公正性。

综上所述，病历中没有会诊邀请函，并不影响司法鉴定机构给出的鉴定的有效性。司法鉴定机构会依据其专业判断和其他相关证据材料，作出独立的鉴定结论。因此，您可以依据该鉴定结论进行后续的法律程序。如有进一步需要，您可以继续咨询我。