公司公章被法院扣押期间，公司法人签字的合同仍然有可能是有效的。下面我将详细解释这一结论：

1. 合同有效性的基础：

   • 一般情况下，合同要有效，需要满足几个基本条件：双方具备民事行为能力、意思表示真实、不违反法律法规强制性规定。只要合同符合这些条件，即使公章被扣押，法人签字的合同仍然可以认定为有效。

2. 公章扣押的影响：

   • 公章被法院扣押，主要影响的是公司使用公章进行日常业务操作的能力，但并不意味着公司法人签字就无效。法人作为公司的法定代表人，其签字同样具有法律效力。

3. 特殊情况的考虑：

   • 如果合同涉及需要公章证明的公司行为（如某些特定的法律文件、合同等），且这种使用是法律法规或合同明确要求的，那么公章被扣押可能会影响合同的有效性。
   • 如果合同存在欺诈、胁迫、重大误解等导致意思表示不真实的情况，或者合同内容违反了法律法规的强制性规定，那么即使法人签字，合同也可能被认定为无效或可撤销。

4. 建议与注意事项：

   • 在公章被扣押的情况下，公司应尽量避免使用需要公章的合同或文件，或者寻求法院的许可来使用公章。
   • 对于需要签订的合同，应确保合同内容合法、双方意思表示真实，并尽量通过其他方式（如电子签名、法人亲笔签字等）来证明合同的效力。
   • 如果对合同的有效性存在疑问，建议咨询专业律师进行法律评估。

综上所述，公司公章被法院扣押期间，公司法人签字的合同在大多数情况下仍然是有效的，但具体还需根据合同的具体内容、签订过程以及法律法规的规定来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。