事业单位休息日加班费的计算方式是，支付的工资报酬应不低于员工工资的百分之二百。具体计算方法如下：

一. 日工资的计算

• 日工资 = 月工资收入 ÷ 月计薪天数
• 月计薪天数通常按照国家规定为21.75天。

二. 小时工资的计算

• 小时工资 = 月工资收入 ÷ (月计薪天数 × 8小时)

三. 加班费计算

• 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。因此，休息日的加班费应按照日工资或小时工资的二倍来计算。

例如，如果某事业单位员工的月工资为6000元，那么在休息日加班一天且没有补休的情况下，其加班费应为：6000元 ÷ 21.75天 × 2 = 约549.90元。

我建议事业单位在安排员工休息日加班时，应严格按照法律规定支付加班费，确保员工的合法权益得到保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。