员工拒绝签劳动合同，用人单位一般不能直接以此为由对员工提起劳动仲裁，但双方若因此发生明确的劳动争议，且协商、调解无果，则用人单位可以申请仲裁。下面我将详细解释这一结论，并提供相应的法律建议。

一、劳动仲裁的适用性与主体适格性

劳动仲裁主要用于解决劳动关系当事人之间因执行劳动法律、法规和履行劳动合同而发生的纠纷。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，因订立劳动合同发生的争议属于劳动争议范畴。然而，员工单纯拒不签订劳动合同的行为，并未直接侵犯用人单位基于劳动法律法规或劳动合同所享有的具体权益，因此在没有进一步劳动争议的情况下，用人单位通常不能直接以此为由申请仲裁。

二、用人单位的正确应对措施

1. 一个月内的情况：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第五条，自用工之日起一个月内，若经用人单位书面通知后，劳动者仍不与用人单位订立书面劳动合同，用人单位有权书面通知劳动者终止劳动关系，且无需支付经济补偿，但需依法支付劳动者实际工作时间的劳动报酬。

2. 超过一个月不满一年的情况：

   • 若劳动者在用工之日起超过一个月不满一年内仍未与用人单位签订书面劳动合同，用人单位应书面通知劳动者终止劳动关系，并按照《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定支付经济补偿。同时，用人单位需要注意保留相关证据，以证明已经尽到了通知和协商的义务。

三、员工可申请仲裁的情形

• 反过来，如果用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同，员工则有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求用人单位支付双倍工资。这一权利依据的是《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条的规定。

四、劳动争议的处理流程

当用人单位与员工之间因劳动合同问题发生争议时，双方应首先尝试协商解决。协商不成的，可以向调解组织申请调解。调解不成或达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

五、法律建议

1. 加强沟通与管理：用人单位应加强与员工的沟通，明确劳动合同的重要性，并尽可能在员工入职时即与其签订书面劳动合同。对于拒不签订劳动合同的员工，应及时书面通知其终止劳动关系，并保留好相关证据。

2. 了解法律权益：员工也应了解自己的法律权益，确保在合法权益受到侵害时能够及时寻求法律救济。如果用人单位未按时签订书面劳动合同，员工可以依法向劳动仲裁机构申请仲裁，维护自己的合法权益。

3. 咨询专业意见：在处理劳动合同争议时，双方都可以咨询专业律师或法律机构的意见，以便更好地了解自己的法律地位和权益，并据此作出合理的决策。

综上所述，员工拒绝签劳动合同并不直接构成劳动仲裁的理由，但双方若因此发生争议且协商无果，则可以通过劳动仲裁途径解决。在处理此类问题时，用人单位和员工都应了解自己的法律权益和义务，并遵循相关法律法规的规定。