纪委调查完贪官虚开普通发票案例后，会根据相关法律法规和党内法规进行严肃处理。具体来说，处理流程可能包括以下几个方面：
一. 纪律审查与调查核实
纪律审查：纪委会首先对涉嫌虚开普通发票套取资金的行为进行纪律审查，包括调查取证、核实事实等。这一阶段旨在全面了解案件情况，收集相关证据，确保后续处理的准确性和公正性。
调查核实：在纪律审查的基础上，纪委会进一步调查核实涉案人员的行为是否构成违纪或违法。这包括对涉案发票的真实性、套取资金的数额、行为人的主观意图等进行深入调查。
二. 党内处分
根据《中国共产党纪律处分条例》及中央纪委、监察部《关于对开具虚假发票公款报销行为党纪政纪处分的暂行规定》等相关规定，纪委会根据涉案人员的违纪情节给予相应的党内处分。处分种类包括警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍等。对于虚开普通发票套取资金的行为，若情节严重，很可能会面临开除党籍的处分。
三. 移送司法机关处理
涉嫌犯罪的处理：若涉案人员的行为构成贪污、挪用公款、私分国有资产等犯罪行为，纪委会将案件移送司法机关处理。司法机关将依法对涉案人员进行审判，并根据其犯罪情节和悔罪表现作出相应的刑事判决。
刑事处罚：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，贪污罪、挪用公款罪、虚开发票罪等犯罪行为将受到相应的刑事处罚。例如，贪污数额较大的，可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；情节特别严重的，可处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
四. 追缴违法所得
根据《中华人民共和国监察法》的相关规定，监察机关在调查过程中发现涉案人员违法取得的财物，依法予以没收、追缴或者责令退赔。对于虚开普通发票套取的资金，纪委会依法追缴并返还给受害单位或上缴国库。
五. 警示与教育
纪委在处理此类案件时，还会注重发挥其警示和教育作用。通过公开通报案件处理情况、组织党员干部学习相关法律法规和党内法规等方式，提醒广大党员干部要时刻保持清醒头脑和廉洁自律的品质，坚决杜绝类似违纪违法行为的发生。
综上所述，纪委在调查完贪官虚开普通发票案例后，会根据相关法律法规和党内法规进行严肃处理，包括纪律审查、党内处分、移送司法机关处理、追缴违法所得以及警示与教育等多个方面。这些措施旨在维护党的纪律和纯洁性，保障国家财产的安全和完整。