结论前置：在土地确权证上只写了一个人的名字，而另一方只签了协议的情况下，该协议的有效性取决于协议的具体内容和相关法律规定。一般来说，如果协议内容合法、双方意思表示真实，且符合相关法律规定的形式要件，那么该协议是有可能有效的。但具体效力还需结合实际情况和法律规定来判断。

分析说明：

1. 协议的有效性：

   • 内容合法性：协议内容必须合法，不能违反国家法律法规的强制性规定，否则协议无效。
   • 意思表示真实：双方签订协议时，必须出于自愿，且意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。
   • 形式要件：根据法律规定，某些类型的协议可能需要采用书面形式，并可能需要见证或公证等程序。如果协议未满足这些形式要件，可能会影响其效力。

2. 土地确权的问题：

   • 土地确权证是证明土地权属的重要文件。如果土地确权证上只写了一个人的名字，那么从法律上来看，该人可能是该土地的唯一合法权利人。
   • 另一方如果只签了协议而未在土地确权证上登记，那么其权利可能无法得到法律的有效保护。在发生纠纷时，可能会面临举证困难、权利无法确认等问题。

3. 建议与措施：

   • 如果双方对土地权属有争议，建议尽快协商解决，并考虑通过法律途径（如诉讼或仲裁）来明确权属。
   • 如果协议内容存在不确定或模糊之处，建议双方重新签订一份明确、具体的协议，并考虑咨询专业律师以确保协议的有效性和合法性。
   • 对于土地等重要资产的权属问题，建议双方谨慎处理，确保权属清晰、明确，以避免未来可能的纠纷和风险。

综上所述，虽然另一方只签了协议可能在一定情况下具有法律效力，但为了确保自身权益得到有效保护，建议双方尽快明确土地权属，并考虑咨询专业律师以确保相关协议和文件的合法性和有效性。如果你有任何进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。