违法查封、强拆经营场所可以申请赔偿停产停业损失。但具体能否获得赔偿，以及赔偿的数额和方式，取决于多个法律因素。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国国家赔偿法》第四条的规定，行政机关及其工作人员在行使行政职权时，若违法对财产采取查封、扣押、冻结等行政强制措施，或造成财产损害的其他违法行为，受害人有取得赔偿的权利。这包括因违法强拆经营场所导致的停产停业损失。

二、赔偿的构成要件

1. 违法行为：首先，必须确认查封、强拆行为是否违法。这包括未按照法定程序进行、缺乏合法的依据等情形。
2. 合法权益受损：被查封、强拆的经营场所必须是合法建筑，且该行为导致了受害人的合法权益受损，即停产停业损失。
3. 直接因果关系：停产停业损失必须与查封、强拆行为存在直接的因果关系。

三、赔偿范围和标准

1. 直接经济损失：包括停产停业期间必要的经常性费用开支，如房租、水电费、设备维护费、职工工资等。
2. 合理的预期利益损失：受害人需提供充分证据证明预期利益的存在和数额，法院会根据具体情况在合理范围内确定赔偿数额。

四、申请赔偿的流程

1. 提出赔偿申请：受害人应先向赔偿义务机关（通常是作出违法行为的行政机关）提出赔偿申请，或在行政复议、行政诉讼中一并提出赔偿请求。
2. 等待决定：赔偿义务机关应在两个月内决定是否赔偿，并制作赔偿决定书或书面通知受害人。
3. 提起行政诉讼：对于不赔偿决定或赔偿数额有异议的，受害人有权提起行政诉讼以维护自身权益。

五、注意事项

1. 及时申请：受害人应在法定两年内提出赔偿申请，否则可能丧失申请赔偿的权利。
2. 充分举证：在申请赔偿时，受害人应提供充分的证据来证明自己的损失和赔偿请求的合理性。
3. 咨询专业意见：在面对复杂的赔偿问题时，建议受害人咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。

综上所述，违法查封、强拆经营场所导致的停产停业损失是可以申请赔偿的。但具体能否获得赔偿以及赔偿的数额和方式，需要根据具体的法律事实和证据来判断。如有需要，请直接向我咨询相关法律问题。