结论：没有营业执照但有证据证明用于生产经营的，在拆迁时能否主张停产停业损失，需结合具体情况判断，一般情况下较难获得补偿，但存在特殊情形时可能获得一定支持。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的规定
合法经营要求：
- 根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》及相关法律规定，停产停业损失的补偿是针对因征收房屋造成停产停业损失的合法经营者。这里的“合法经营者”通常指的是持有有效营业执照并依法纳税的市场主体。
- 没有营业执照意味着经营行为可能未得到相关部门的认可或批准，属于非法经营。因此，在拆迁过程中，这类经营主体通常不被视为合法的被征收人，也就无法享受停产停业损失的补偿。
无证经营的风险：
- 无证经营不仅可能面临行政处罚，而且在拆迁时也难以获得法律上的保护。拆迁补偿主要是针对合法经营者的损失进行补偿，无证经营者往往难以证明其经营行为的合法性，从而难以获得补偿。
二、特殊情况下的考量
历史遗留问题：
- 在某些情况下，由于历史原因或政策调整，一些经营主体虽然未办理营业执照，但实际上已经长期存在并正常经营。对于这类情况，如果政府或相关部门在拆迁前进行了调查核实，并认定其经营行为的合法性或合理性，那么可能会给予一定的补偿。
- 但这需要具体的政策依据和政府的裁量。不同地区、不同时间段的政策可能有所不同，因此需要具体分析当地政策规定。
实际损失评估：
- 即使经营主体没有营业执照，但如果能够证明其因拆迁而遭受了实际的停产停业损失（如设备搬迁费用、员工安置费用等），并且这些损失与拆迁行为之间存在直接的因果关系，那么理论上可以主张相应的赔偿。
- 这需要提供充分的证据来支持其主张，如经营记录、合同、发票等证明经营行为和损失的材料。然而，在实际操作中，无证经营者往往难以提供完整的证据链来证明其损失，因此获得补偿的难度较大。
三、法律建议
尽量补办营业执照：
- 如果经营主体尚未办理营业执照，建议尽快补办，以符合合法经营的要求。这样在拆迁时就能更容易地获得停产停业损失的补偿。
收集并保存证据：
- 如果确实无法补办营业执照，那么应尽可能收集并保存能够证明经营行为和损失的材料。这些材料在主张赔偿时将起到关键作用。
咨询专业律师：
- 在面对拆迁补偿问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据当地政策规定和实际情况，为经营主体提供有针对性的法律帮助。
最后，虽然无证经营在拆迁时较难获得停产停业损失的补偿，但并非绝对不可能。如果存在历史遗留问题或能够证明实际损失，那么仍有可能获得一定的补偿。因此，在面对拆迁补偿问题时，应积极收集证据并咨询专业律师以维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。