层层分包的工资支付责任由分包单位承担直接责任，施工总承包单位承担先行清偿责任。具体分析如下：

一. 分包单位的直接责任

• 根据《保障农民工工资支付条例》第三十条，分包单位对所招用农民工的实名制管理和工资支付负直接责任。这意味着，分包单位需要直接向其招用的农民工支付工资，并确保支付的及时性和准确性。

二. 施工总承包单位的先行清偿责任

• 同样依据《保障农民工工资支付条例》第三十条，如果分包单位拖欠农民工工资，施工总承包单位需要先行清偿，再依法进行追偿。这一规定确保了农民工的工资权益得到保障，即使分包单位出现支付问题，施工总承包单位也有责任先行支付。

三. 违法分包的法律责任

• 根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条，承包单位将承包的工程转包或违法分包的，将受到责令改正、没收违法所得、罚款等处罚，并可能面临停业整顿、降低资质等级或吊销资质证书等严重后果。此外，承包单位还需对因转包或违法分包导致的损失承担连带赔偿责任。虽然这一条款主要关注的是违法分包行为的法律责任，但也间接强调了分包单位在工资支付方面的责任，以及施工总承包单位在监督和管理分包单位方面的义务。

综上所述，在层层分包的情况下，分包单位对农民工的工资支付承担直接责任，而施工总承包单位则承担先行清偿责任。这一制度设计旨在保障农民工的合法权益，确保他们能够及时、足额地获得劳动报酬。如有进一步需要，您可以继续咨询我。