交通事故致两人死亡且负主责的情况下，通常是不能避免司法程序的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条的规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，将依法追究刑事责任。在交通事故中致两人死亡且负主要责任，这明显构成了交通肇事罪，因此，司法程序的介入是必然的。
二、司法程序的可能性
刑事起诉：
- 交通事故致两人死亡，且肇事者负主要责任，检察院会依据案件的具体状况来决定是否起诉。通常情况下，这类案件会提起公诉，由法院进行审判。
民事赔偿：
- 除了刑事责任，肇事者还需要承担民事赔偿责任。受害者的家属有权提起民事诉讼，要求肇事者赔偿因事故造成的经济损失和精神损害。
三、特殊情况下的不起诉可能性
虽然一般情况下会面临司法程序，但在某些特殊情况下，可能存在不起诉的可能性：
法定不起诉：
- 若事故情节显著轻微，危害不大，且难以完全归责于犯罪嫌疑人，经过严格审查后，可能适用《刑事诉讼法》第十六条的法定不起诉条款。但这种情况在实际操作中极为罕见。
酌定不起诉：
- 肇事者若积极赔偿被害方并获得谅解，有自首、立功等表现，检察院可能会根据《刑事诉讼法》第一百七十七条第二款的规定，作出酌定不起诉决定。但这需要肇事者有极其良好的悔罪表现和积极的赔偿行动。
证据不足不起诉：
- 如果案件经过二次补充侦查仍证据不足，不符合起诉条件，检察院会作出证据不足不起诉的决定。但这并不意味着肇事者没有责任，只是由于证据问题而暂时避免了司法程序的进一步追究。
四、建议与指导
- 积极面对：事故发生后，应积极配合警方的调查工作，明确事故责任和事实。
- 努力赔偿：在条件允许的情况下，应积极与被害人家属协商赔偿事宜，努力获得他们的谅解。
- 法律咨询：面对复杂的法律问题，应及时向我咨询，以确保自身权益得到妥善保护。
综上所述，交通事故致两人死亡且负主责的情况下，通常是不能避免司法程序的。但肇事者可以通过积极面对、努力赔偿和寻求法律咨询等方式，来尽量减轻自己的法律责任和后果。