针对您提出的“孩子的抚养权是妈妈，但给学校的协议是爸爸，怎么办”的问题，以下是我的详细解答：

结论前置：

抚养权的归属是决定孩子日常生活、教育及成长环境的关键因素。即使学校协议上写的是爸爸，但实际抚养权归属于妈妈，妈妈仍应确保孩子的合法权益得到全面保障。对于学校协议与抚养权归属不一致的情况，可通过与学校沟通、提供法律文件等方式解决。

详细分析：

1. 明确抚养权归属：

   • 首先，确认抚养权判决书或离婚协议书等法律文件，明确抚养权归属于妈妈。
   • 这些法律文件是处理后续问题的关键依据。

2. 与学校沟通：

   • 妈妈应尽快与学校取得联系，说明抚养权的实际情况，并提供相关法律文件作为证明。
   • 与学校协商，更正学校协议中的抚养权人信息，确保与实际情况一致。

3. 法律支持：

   • 如果学校拒绝更正或提出异议，妈妈可以依据抚养权判决书或离婚协议书等法律文件，向法院提起诉讼或申请强制执行。
   • 法院将依据法律规定和孩子的最佳利益原则，作出相应判决或裁定。

4. 关注孩子的需求：

   • 在处理此问题的过程中，妈妈应特别关注孩子的心理需求和情感变化，确保孩子不受此影响。
   • 与孩子保持沟通，解释情况，让孩子感受到妈妈的爱和关怀。

总结与建议：

面对学校协议与抚养权归属不一致的情况，妈妈应首先明确抚养权归属，并与学校进行积极沟通。如遇困难，可依法维护自己的合法权益，同时确保孩子的合法权益得到全面保障。如有需要，可直接向我咨询，我将为您提供更具体的法律建议和支持。