公司规定一天只能上两次厕所是不合理的，且可能违法。下面我将从法律角度对此进行分析：

一. 侵犯员工基本人权

1. 人身自由受保护：根据《中华人民共和国宪法》第三十七条，中华人民共和国公民的人身自由不受侵犯。任何公民，非经人民检察院批准或者决定或者人民法院决定，并由公安机关执行，不受逮捕。上厕所是员工的基本生理需求，公司无权限制。
2. 人格尊严受尊重：根据《中华人民共和国民法典》第一百零九条，自然人的人身自由、人格尊严受法律保护。限制员工上厕所的次数，无疑是对员工人格尊严的践踏。

二. 违反劳动法规

1. 劳动条件应合理：根据《中华人民共和国劳动法》第三条，劳动者享有获得劳动安全卫生保护的权利。公司规定一天只能上两次厕所，可能导致员工在生理需求无法得到满足的情况下工作，这显然不符合劳动安全卫生的要求。
2. 劳动纪律不应侵犯合法权益：虽然公司有权制定劳动纪律，但根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动纪律的制定应当合法、合理，不得侵犯员工的合法权益。限制员工上厕所的次数，显然是对员工合法权益的侵犯。

三. 实际影响与后果

• 例如，如果员工因为公司的不合理规定而导致身体健康受损，公司可能需要承担相应的法律责任。同时，这样的规定也会严重影响员工的工作积极性和对公司的忠诚度。

综上所述，公司规定一天只能上两次厕所是不合理的，且可能违反相关法律法规。我建议公司应当尊重员工的基本人权和合法权益，制定更加人性化、合理的劳动纪律。如有进一步需要，您可以继续咨询我。