政府采购合同可以通过签订补充协议的形式延长合同履行期限，但需注意相关法律规定和限制。

首先，根据相关法律法规，政府采购合同的双方当事人不得擅自变更、中止或者终止合同。然而，在特定情况下，如政府采购合同继续履行将损害国家利益和社会公共利益时，双方当事人可以协商变更、中止或者终止合同。这表明，在符合法定条件的情况下，合同内容的变更（包括延长履行期限）是被允许的。

其次，关于签订补充协议的具体规定，虽然法律没有直接禁止通过补充协议延长政府采购合同的履行期限，但实际操作中需要遵循一定的原则和限制。特别是，根据《中华人民共和国政府采购法》的相关规定，采购人需追加与合同标的相同的货物、工程或者服务的，可以与供应商协商签订补充合同，但所有补充合同的采购金额不得超过原合同采购金额的百分之十。这一规定虽然主要关注的是补充合同的采购金额，但也间接说明了签订补充协议需要遵循一定的法律框架和限制。

因此，在延长政府采购合同履行期限时，建议遵循以下步骤：

1. 评估必要性：首先评估延长合同履行期限的必要性，确保这一变更符合合同双方的利益，并且不会损害国家利益和社会公共利益。
2. 协商一致：与合同对方进行充分协商，确保双方就延长履行期限达成一致意见。
3. 遵守法律规定：在签订补充协议时，严格遵守相关法律法规的规定，特别是关于补充合同采购金额的限制。
4. 正式签订：以书面形式正式签订补充协议，明确延长后的履行期限及相关权利义务。

总之，虽然政府采购合同可以通过签订补充协议的形式延长合同履行期限，但在实际操作中需要谨慎处理，确保符合法律规定并维护合同双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。