在构成表见代理的情况下，工程款应由被代理人承担。以下是对此结论的详细分析：
一. 表见代理的法律效力
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百七十二条，行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，但相对人有理由相信行为人有代理权的，该代理行为有效。这意味着，在表见代理的情况下，尽管行为人实际上没有代理权，但其代理行为对被代理人产生法律效力。
二. 工程款的承担主体
- 由于表见代理的代理行为对被代理人有效，因此，由该代理行为所产生的法律后果，包括工程款的支付义务，也应由被代理人承担。
- 举例说明：假设某工程项目经理（行为人）在没有获得公司（被代理人）明确授权的情况下，与施工方签订了施工合同，并导致了工程款的支付义务。如果施工方有理由相信该项目经理有代理权（例如，项目经理之前曾代表公司签订过类似合同），那么该施工合同在法律上就是有效的，公司（被代理人）需要承担支付工程款的责任。
三. 其他相关法律规定
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百七十一条，如果行为人没有代理权而实施代理行为，且未经被代理人追认，则该行为对被代理人不发生效力。但在表见代理的情况下，由于相对人有理由相信行为人有代理权，因此这一规定不适用。
- 另外，《中华人民共和国民法典》第一百六十二条也规定了代理人在代理权限内实施的民事法律行为对被代理人发生效力，这进一步支持了表见代理情况下工程款应由被代理人承担的观点。
综上所述，在构成表见代理的情况下，工程款应由被代理人承担。这是基于表见代理的法律效力以及由此产生的法律后果所决定的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。