实习三方协议公司盖章和实习章并不完全一样。在详细解释之前，我们先明确一点：三方协议是普通高等学校毕业生、毕业研究生就业协议书的简称，它涉及到毕业生、用人单位、学校三方的权利和义务。

1. 公司盖章：

   • 公司盖章通常指的是公司公章或合同专用章，这些印章具有法律效力，能够代表公司的意志和承诺。
   • 在三方协议上加盖公司公章或合同专用章，即表明公司对协议中约定的权利和义务予以全面认可。

2. 实习章：

   • 实习章可能是公司内部用于管理实习生或实习事务的专用印章，其法律效力可能受限。
   • 实习章并不一定能够代表公司的全面意志，可能只是用于证明实习生在公司的实习身份或实习经历。

因此，在签订三方协议时，应当加盖公司公章或合同专用章，以确保协议的合法性和有效性。如果加盖的是实习章，可能会引发后续的法律纠纷或问题，因为实习章可能无法充分证明公司对协议内容的认可和承诺。

综上所述，实习三方协议公司盖章和实习章在法律效力和代表意义上是有所区别的。在签订协议时，请务必注意加盖正确的印章，以确保自己的权益得到充分保障。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。