认罪认罚分案后，一般会分开判决。具体分析如下：

在刑事案件中，如果多个被告人被共同起诉，但其中部分被告人选择认罪认罚，而部分被告人选择不认罪或者进行辩护，法院为了更清晰地审理案件，可能会决定对案件进行分案处理。分案处理意味着将原本一起审理的案件拆分成多个案件，分别进行审理和判决。

1. 分案审理的必要性：

   • 提高审判效率：分案审理可以使得每个案件的审理更加集中和高效，避免因为不同被告人的认罪态度而拖延整个案件的审理进程。
   • 保障被告人权益：对于选择认罪认罚的被告人，分案审理可以确保他们的认罪认罚得到及时的确认和量刑，避免因为与其他被告人的案件纠缠在一起而受到影响。
   • 确保审判公正：分案审理可以使得每个案件的审理更加独立和公正，避免因为不同被告人的相互指认或者辩解而对审判结果产生干扰。

2. 分开判决的合理性：

   • 基于案件事实：每个被告人的犯罪事实、情节和认罪态度都是不同的，分开判决可以更加准确地根据每个被告人的具体情况进行量刑。
   • 符合法律程序：分开判决是符合刑事诉讼程序的，法院在审理案件时需要根据案件的具体情况和被告人的认罪态度来作出判决。
   • 体现司法公正：分开判决可以确保每个被告人都受到公正的审判，避免因为与其他被告人的案件混淆而导致司法不公。

综上所述，认罪认罚分案后，法院一般会根据案件的具体情况和被告人的认罪态度进行分开判决。这样做既提高了审判效率，又保障了被告人的权益，同时也确保了审判的公正性。如果你有更具体的案件情况或者疑问，可以直接向我咨询。