村集体扣除占村集体的耕地补偿金的20%通常是不合理的。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据：
- 根据相关法律法规，农村集体经济组织在征收土地时，应当依法及时足额支付土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用，并保障被征地农民的生活，维护其合法权益。
- 任何组织或者个人不得贪污、挪用、私分、截留、拖欠征收补偿费等费用。因此，村集体若未经授权擅自抽取、扣押征地补偿费，其行为是违法的。
村集体扣除补偿金的合理性分析：
- 村集体在未经法定程序、未经村民共同认可的情况下，擅自扣减征地补偿金是不合理的，也是违法的。
- 即使村集体出于公共事业建设的需要，也必须遵守相关法律法规，按照法定程序进行，并经过全体村民的共同认可。同时，应确保其截留比例适度，监管力度清晰明了，且清楚地表明资金用途，并在执行过程中自觉接受社会公众的持续监督。
村民的权益保障：
- 村民有权了解征地补偿金的支付、使用和监督等方面的规定，并积极参与监督过程。
- 若发现村集体有违法违规行为，村民应及时向相关部门进行举报，并要求返还被扣占的补偿费用。
综上所述，村集体扣除占村集体的耕地补偿金的20%通常是不合理的，除非经过法定程序和村民的共同认可，且用途明确、监管到位。若村民认为自己的权益受到侵害，应及时向相关部门反映情况并寻求法律援助。