刑事案件撤案的理由和依据主要依据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，具体有以下几种情况：
情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的：例如，一些轻微的违法行为，未达到刑法规定的入罪标准，如轻微的盗窃行为，未达到一定数额标准或未造成严重后果。
犯罪已过追诉时效期限的：不同犯罪有不同的追诉时效，超过该时效则不再追究。例如，法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年等。
经特赦令免除刑罚的：若案件发生时罪犯符合特赦条件并被特赦，则案件可以撤销。
依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的：如侮辱罪、诽谤罪等，这类犯罪需要被害人主动告诉才处理，若被害人没有告诉或者撤回告诉，则案件可以撤销。
犯罪嫌疑人、被告人死亡的：因刑事责任主体不存在，无法继续追诉，案件因此可以撤销。
其他法律规定免予追究刑事责任的：当出现其他法律中明确规定的免予追究刑事责任的情形时，也可以撤销案件。
撤案需由公安机关、人民检察院等依法作出决定。若被害人对撤案决定不服，可在法定期限内申请复议或向检察院申诉，检察院会进行审查并作出相应处理。在侦查过程中，一旦发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当立即撤销案件，并解除相应的强制措施，如拘留、逮捕等。