如果对方在摩托车事故中只愿意赔偿医药费，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 明确赔偿范围：

   • 首先，你需要了解交通事故赔偿不仅仅包括医药费，还可能包括误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、营养费、残疾赔偿金、残疾辅助器具费、丧葬费、被扶养人生活费、精神损害抚慰金等多项费用。
   • 根据事故的具体情况和你的实际损失，明确你应得的赔偿项目和金额。

2. 协商处理：

   • 在明确赔偿范围后，你可以尝试与对方进行协商，看是否能够就赔偿问题达成一致。
   • 在协商过程中，要保留好相关证据，如医疗费用单据、收入证明等，以便在需要时提供证明。

3. 寻求交警部门帮助：

   • 如果协商无果，你可以向交警部门求助，请求他们进行调解或出具事故责任认定书。
   • 交警部门的事故责任认定书是处理交通事故赔偿的重要依据，可以帮助你明确双方的责任比例。

4. 法律途径维权：

   • 如果交警部门的调解也无法解决问题，或者对方拒绝履行赔偿义务，你可以通过法律途径来维护自己的权益。
   • 你可以向法院提起民事诉讼，要求对方按照法律规定赔偿你的全部损失。
   • 在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来证明自己的主张，并依法参与庭审活动。

5. 注意保留证据：

   • 在整个处理过程中，你都要注意保留好相关证据，如事故现场照片、交警事故认定书、医疗费用单据、收入证明等。
   • 这些证据将是你维权的重要依据，也是你获得合理赔偿的关键。

综上所述，如果对方在摩托车事故中只愿意赔偿医药费，你可以通过明确赔偿范围、协商处理、寻求交警部门帮助以及法律途径维权等方式来维护自己的合法权益。在处理过程中，要注意保留好相关证据，以便在需要时提供证明。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。