同等责任下，医药费原则上由双方各自承担50%，但具体处理需结合实际情况分情况讨论。以下是详细分析：

1. 同等责任的法律含义
   根据《道路交通安全法》第七十六条，机动车与非机动车（电瓶车通常被认定为非机动车）发生事故，若双方同等责任，通常指双方对事故发生的作用和过错程度相当。此时，双方需按比例分担损失，包括医药费、误工费等合理费用。

2. 医药费分担的具体规则

   • 若双方均为机动车（如摩托车与电动摩托车）：
     医药费由双方交强险在限额内先行赔付（摩托车交强险医疗费限额为1.8万元），超出部分按50%比例分担。例如：总医药费3万元，交强险赔付后剩余1.2万元，双方各承担6000元。
     
   • 若一方为非机动车（电瓶车）：
     根据《民法典》第一千二百零八条，非机动车驾驶人无需购买交强险，但需按过错比例承担责任。若电瓶车被认定为非机动车，摩托车方需先用交强险赔付，超出部分由双方按50%分担。例如：总医药费3万元，摩托车交强险赔付1.8万元后剩余1.2万元，双方各承担6000元。
     
   • 若电瓶车被认定为机动车（如超标电瓶车）：
     需按机动车规则处理，双方交强险赔付后，超出部分按50%分担。但实务中，超标电瓶车可能因未投保交强险而面临行政处罚，且需在交强险限额内自行承担赔偿责任。

3. 实务中的关键点

   • 证据固定：需保留医疗费发票、诊断证明、事故认定书等材料，以证明费用合理性。
     
   • 保险理赔：摩托车方应优先联系保险公司，由交强险赔付；若电瓶车方有商业险（如第三者责任险），也可参与赔付。
     
   • 协商与诉讼：双方可协商分担比例，若协商不成，可通过交警调解或向法院起诉，由法院根据证据判定责任。

4. 特殊情形提示

   • 若一方存在故意或重大过失（如酒驾、闯红灯），可能被认定为主责或全责，需承担更高比例费用。
     
   • 若伤者需后续治疗（如康复费、残疾赔偿金），可在治疗终结后一并主张，按同等责任分担。

建议：

1. 立即报警并取得《交通事故责任认定书》，明确责任比例；
   
2. 保存所有医疗费用凭证，避免遗失；
   
3. 优先通过保险理赔，减少个人负担；
   
4. 若协商无果，及时委托律师介入，通过法律途径解决。
   

如有其他细节需要进一步分析（如电瓶车是否超标、是否有保险等），可直接向我咨询。