如果在厂里干活被扣工时，你可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：

首先，你需要与工厂的相关负责人，比如班组长、车间主管或人力资源部门进行友好沟通。明确表达对扣工时的不满，并要求他们给出具体的扣工时理由。在这个过程中，你可以查阅工厂的员工手册、规章制度等文件，确认扣工时是否符合规定，并核实自己的考勤记录、工作任务记录等相关资料，以确保自己的权益没有受到不当侵害。

如果沟通后你认为扣工时存在不合理之处，接下来应该开始收集并保存所有相关证据。这些证据包括但不限于工时记录、工资条、与工厂的沟通记录（如邮件、短信、电话记录等）、同事证言，以及员工手册、规章制度等文件。这些证据在后续的法律程序中将起到至关重要的作用，它们将用于证明你的权益确实受到了侵害。

在收集了足够证据后，你可以再次尝试与工厂进行协商，提出合理的诉求，比如要求工厂重新核对工时、补发被扣的工资或调整工时安排等。在协商过程中，请保持冷静和理智，避免情绪化表达，这样有助于增加协商成功的可能性。

如果协商仍然无法解决问题，你可以根据《劳动保障监察条例》的相关规定，向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对工厂的扣工时行为进行调查，并责令工厂限期支付劳动者的工资报酬。如果工厂逾期不支付，还将面临加付赔偿金的处罚。

如果劳动监察部门的处理结果仍然无法满足你的诉求，你可以根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，你需要提交书面的仲裁申请书，并附上相关证据来支持自己的诉求。仲裁委员会将依法进行审理，并作出裁决。

如果你对仲裁结果不服，还可以在规定的期限内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来支持自己的诉求，人民法院将根据法律规定和事实情况进行判决。

此外，如果工厂的扣工时行为严重侵害了你的权益，你还可以依据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，解除劳动合同并要求经济补偿。经济补偿的标准通常按劳动者在本单位工作的年限来计算，具体数额可以咨询专业律师或法律机构。

在整个维权过程中，如果你感到自己的权益受到了严重损害且难以自行应对，可以寻求法律援助或咨询专业律师的意见。他们将为你提供专业的法律建议和指导，帮助你更有效地维护自己的合法权益。