关于“员工社保从自己账户扣除是否合法”的问题，首先我们要明确一点：社保费用的缴纳是遵循国家法律法规的，并且有一定的规定和流程。

根据相关规定，员工个人应承担的社保部分，是包含在企业发放的工资薪金内的。也就是说，员工的社保费用个人部分，应由所在单位从其本人工资中代扣代缴。这是合法的，也是符合社保缴纳流程的。企业不能私下与员工就社会保险费进行其他约定，必须按照国家规定执行。

同时，企业为员工缴纳的社保费用（包括企业应承担的部分），在一定条件下是可以在企业所得税税前扣除的。但这与员工个人应承担的社保部分没有直接关系，员工个人部分的社保费用依然是从其工资中代扣代缴。

此外，值得注意的是，无论是劳务派遣工还是聘用人员，都应该依法为其缴纳社保费。参保单位应在员工入职之日起三十日内为其办理参保登记并缴纳社保费，这是法律规定的义务，不能违反。

综上所述，员工社保从自己账户扣除（即企业从员工工资中代扣代缴社保个人部分）是合法的，也是符合社保缴纳规定的。如果有任何单位或个人试图违反这一规定，都是不合法的行为。希望这个解答能够帮助您更好地了解社保缴纳的相关问题。