关于员工提交的续签申请是否有效，这主要取决于几个关键因素，我会为你详细解析：

首先，要明确员工的身份和续签的背景。如果是根据行业输入劳工计划来港工作，并且因为护照或旅行证件的有效期等原因，导致入境后获准的逗留期限短于雇佣合约期，那么在延长护照或旅行证件的有效期，并获得雇主确认继续聘用后，员工是可以使用网上服务递交延长逗留期限的申请，以完成现有合约的剩余期间的。这是符合相关规定的。

然而，有几个需要注意的点：

1. 合约状态：一般而言，如果输入劳工的雇佣合约已经届满或终止，那么将不会获准延长逗留期限。此时，如果希望继续留在港工作，需要订立新的雇佣合约，并重新递交签证或进入许可申请。
2. 申请资料的准确性：在递交续签申请时，员工必须提供正确、完备和真实的资料。如果资料有误，可能会导致申请无效。因此，在申请前，请务必仔细核对所有资料，确保其准确无误。
3. 所需文件的递交：根据规定，网上申请延长逗留期限时，可能需要递交一些必要的文件。这些文件通常包括护照、旅行证件、雇佣合约等。申请人需要按照要求，将文件扫描并储存为指定的档案格式，然后上载到申请系统。如果未能按照要求递交所需文件，也可能会影响申请的的有效性。

综上所述，员工提交的续签申请是否有效，取决于其身份、合约状态、申请资料的准确性以及所需文件的递交情况。如果员工符合相关规定，并且按照要求递交了正确的申请资料和所需文件，那么其续签申请应该是有效的。如果仍有疑问或需要进一步的帮助，建议咨询相关的入境事务处或专业机构以获取更详细的信息和指导。