如果个税手续费逾期未退，首先需要明确的是，一般来说，代扣代缴个人所得税手续费退付的申请有一个明确的期限，通常在每年的3月30日之前。如果超过了这个期限，可能会被视为自动放弃上一年度的个税扣缴手续费。

然而，具体的处理方式可能会因地区和具体情况有所不同。建议您首先联系当地的税务机关，了解是否有可能进行逾期申请，以及申请的具体流程和所需材料。

如果税务机关表示无法进行逾期申请，那么您需要了解并接受这个结果。但您也可以询问是否有其他可能的补助或优惠政策，以减轻因错过申请期限而带来的损失。

此外，为了避免类似情况在未来再次发生，建议您提前了解并关注个税扣缴手续费的退付政策，确保在规定的期限内完成申请。

总的来说，处理个税手续费逾期未退的问题需要您与税务机关进行积极的沟通和了解，并根据实际情况采取相应的措施。