事业单位控制编和正式编的主要区别体现在编制性质、工作稳定性以及福利待遇上。
编制性质：
- 正式编：正式编制的员工与单位签订的是长期或无固定期限的劳动合同，他们是事业单位稳定的成员，享有较高的职业保障。
- 控制编：控制编制通常是指事业单位在人手不足或者特定项目需求下，临时增加的工作人员。他们与单位签订的往往是固定期限的劳动合同，工作性质相对不那么稳定。
工作稳定性：
- 正式编：由于签订了长期或无固定期限劳动合同，正式编制员工的工作相对稳定，除非出现严重违反工作规定或法律的情况，否则职位较为稳固。
- 控制编：由于控制编制员工通常签订的是固定期限合同，合同到期后，单位有权选择是否续签，因此工作稳定性相对较低。
福利待遇：
- 正式编：正式编制员工通常享有更全面的福利待遇，包括但不限于各种保险、住房补贴、年终奖金等，且通常会有更多的晋升机会和职业培训。
- 控制编：虽然控制编制员工也享有一定的福利待遇，但相较于正式编制员工，可能没有那么全面或优厚。晋升机会和职业培训可能也相对较少。
总的来说，事业单位的控制编和正式编在编制性质、工作稳定性以及福利待遇方面存在显著差异。这些差异主要体现在员工的工作保障、合同期限以及享受的福利待遇上。