关于您提出的一户两宅基地如何确权的问题，这需要根据具体情况，通过合法合规的途径来解决。以下是对此问题的详细解答：
一、明确宅基地确权的基本原则
- 一户一宅原则：根据《土地管理法》，农村村民一户只能拥有一处宅基地，且宅基地的面积不得超过当地规定的标准。
- 合法合规原则：宅基地的确权必须遵循相关法律法规，对于非法占用的宅基地，政府有权进行处理。
二、一户两宅基地的确权方式
符合分户条件的情况：
- 如果一户家庭内有多名子女且已成年，符合分户条件但尚未分户的，可以先向当地户籍管理部门申请办理分户手续。
- 分户完成后，再按照正常的宅基地确权程序，分别对两户的宅基地进行确权登记。
因继承等合法原因形成的情况：
- 如果一户两宅基地是因继承等合法原因形成的，可以依据合法的继承证明文件（如遗嘱、法定继承关系证明等），到当地的不动产登记部门申请宅基地及房屋的确权登记。
- 在此过程中，应遵循“地随房走”的原则，即宅基地不能单独继承，但可以通过继承房屋来获得宅基地的使用权。
不符合分户条件且无合法原因的情况：
- 对于不符合分户条件且无合法原因形成的一户两宅基地，可能需要对超出当地规定的宅基地面积标准的部分进行处理。
- 具体处理方式可能包括有偿使用、过渡性管理等，具体需根据当地政策来确定。
双方协商确权：
- 如果两户之间能够协商达成一致，可以通过协商确定各自的宅基地面积，并分别进行确权登记。
- 如果协商无法达成一致，需要待纠纷通过法律途径或其他方式解决后再进行确权登记。
三、确权流程
- 提出申请：向当地乡（镇）人民政府提出确权申请，并提交相关证明材料（如身份证、户口簿、宅基地使用证明等）。
- 审核调查：乡（镇）人民政府会对申请材料进行审核，并组织实地调查和测量。
- 确权登记：审核通过后，由县级以上人民政府进行确权登记，并颁发土地使用权证书。
四、注意事项
- 尊重意愿：在确权过程中应充分尊重两户的意愿，通过协商避免矛盾和纠纷。
- 公开公正：确权结果应确保公开、公正、公平，保障两户的合法权益不受侵害。
- 合法合规：对于违法取得的宅基地，政府有权无条件收回，并对相关责任人进行处罚。
综上所述，一户两宅基地的确权问题需要根据具体情况进行具体分析，并遵循相关法律法规和政策进行处理。建议您及时与当地相关部门沟通咨询，以顺利完成确权工作。