对于一处宅基地上有两处房子的情况，确权过程需要遵循一定的法律程序和原则来确保公正、合理。以下是对这一问题的详细解答：
首先，要明确的是，确权的核心在于确定两处房子的产权归属。这通常涉及到查看相关的土地使用证、建房审批手续等文件，以验证两处房子的建设是否合法合规。
合法建设的确权：
- 如果两处房子均为合法建设，那么应根据实际居住情况、出资情况等综合因素来判断产权归属。
- 例如，如果一处房子由原宅基地所有者居住，另一处由他人出资建设，那么原宅基地所有者通常享有主要产权，而出资建设者则可以通过协商等方式来确定其相应的权益。
违规建设的处理：
- 如果两处房子中存在违规建设的情况，那么需要根据具体的违规情节和相关规定来处理。
- 这可能包括罚款、拆除等后果。在处理完违规问题后，再进行确权工作。
产权争议的解决：
- 如果双方对产权归属存在争议，那么可以通过协商、调解或诉讼等方式来解决。
- 协商和调解是更为温和的方式，而诉讼则是通过法律途径来确保确权工作的公正性和合理性。
此外，还有一些特殊情况需要注意：
- 一户两宅的情况：如果一处宅基地上住了两户，那么两户可以共同协商，确定各自的宅基地面积，并分别将确定的面积确权在自己的名下。如果存在纠纷，则需要先解决纠纷再进行确权登记。
- 放弃确权的情况：在一户两宅的情况下，如果两户协商后，一户愿意放弃确权，那么该户可以再向村集体申请一处宅基地来建设使用，并进行确权登记。这样既可以解决一宅两户的问题，又符合“一户一宅”的规定。
总的来说，一处宅基地上有两处房子的确权工作需要根据实际情况进行灵活处理。在确权过程中，应遵循相关法律法规和政策规定，确保确权工作的公正性、合理性和合法性。同时，双方也应积极配合，通过协商、调解等方式解决可能存在的产权争议。