在建设用地上建厂房，需要遵循一系列的手续和规定。以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

首先，根据《建筑工程施工许可管理办法》，在中华人民共和国境内从事各类房屋建筑及其附属设施的建造，建设单位在开工前需要向工程所在地的县级以上地方人民政府住房城乡建设主管部门申请领取施工许可证。对于工程投资额在30万元以下或者建筑面积在300平方米以下的建筑工程，可以不申请办理施工许可证，但具体限额可能会根据当地实际情况有所调整。

在申请施工许可证时，建设单位需要满足以下条件并提交相应的证明文件：

1. 已经办理该建筑工程用地批准手续，即依法应当办理用地批准手续的已经办理完毕。
2. 已经取得建设工程规划许可证，确保建设项目符合城市规划和土地利用规划。
3. 施工场地已经基本具备施工条件，如果涉及房屋征收，其进度应符合施工要求。
4. 已经确定施工企业，并且该施工企业具备相应的资质条件。
5. 有满足施工需要的资金安排、施工图纸及技术资料，并提供建设资金已经落实的承诺书，以及施工图设计文件已按规定审查合格的证明。
6. 有保证工程质量和安全的具体措施，包括施工企业编制的施工组织设计中有根据建筑工程特点制定的相应质量、安全技术措施，以及建立工程质量安全责任制并落实到人。

申请施工许可证的具体程序如下：

1. 建设单位向发证机关领取《建筑工程施工许可证申请表》。
2. 填写并加盖单位及法定代表人印鉴的申请表，附带上述提到的证明文件，向发证机关提出申请。
3. 发证机关在收到申请后，将进行审查。对于符合条件的，将在七日内颁发施工许可证；对于证明文件不齐全或失效的，将告知需要补正的内容；对于不符合条件的，将书面通知建设单位并说明理由。

此外，如果建设单位在建设过程中发生变更，或者施工许可证上的工程名称、地点、规模与施工承包合同不符，都需要重新申请领取施工许可证。施工许可证应放置在施工现场备查，并按规定在施工现场公开。

需要注意的是，临时厂房是否能办理房屋产权证书，需要根据《不动产登记暂行条例实施细则》的相关规定来判断。如果临时厂房符合规划、已经竣工，并且具备相关税费缴纳凭证等材料，那么权利人可以到当地不动产登记机构申请登记。但具体能否办理，还需根据当地政策和实际情况来确定。

综上所述，在建设用地上建厂房需要办理施工许可证，并满足一系列的条件和提交相应的证明文件。同时，对于临时厂房的产权问题，也需要根据相关规定进行申请和登记。希望这些信息能对您有所帮助。