员工休假期间的工资计算与扣除确实是一个需要细致考虑的问题，它涉及到国家法律法规以及公司内部的规章制度。以下是对员工休假扣工资计算方式的详细解答：

一、不扣工资的情况

1. 法定节假日：如元旦、春节等，这些节日是法律规定的带薪休假日。员工在这些节日休假时，用人单位必须按照劳动合同规定的标准全额支付工资，不得有任何扣除。

2. 年休假：员工依法享受的年休假期间，应享有与正常工作期间相同的工资收入。根据《职工带薪年休假条例》，用人单位需正常发放工资，不得扣除。

3. 婚假、产假、陪产假等：这些假期通常也属于带薪休假范畴。在符合法律法规规定的假期天数内，用人单位应正常支付员工工资。

二、可能扣工资的情况

1. 病假：

   • 员工因病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内，用人单位需支付病假工资或疾病救济费。
   • 病假工资的计算通常不低于当地最低工资标准的80%，具体公式为：病假工资 = 当地最低工资标准 × 80% ÷ 21.75 × 病假天数。
   • 若员工正常日工资高于此计算结果，则按病假工资标准发放；若低于，则按正常日工资发放。

2. 事假：

   • 员工因个人原因请假时，用人单位会扣除当天工资。
   • 扣除金额的计算公式为：扣除工资 = 日工资 × 事假天数，其中日工资 = 月工资收入 ÷ 月计薪天数（通常为21.75天）。

三、工资计算的具体方法

1. 正算法：工资 = 月薪 ÷ 21.75 × 月计薪天数 × (出勤天数比例)。
2. 反算法：工资 = 月薪 - 月薪 ÷ 21.75 × 缺勤天数 × (出勤天数比例)。

四、综合考虑

在处理员工休假工资问题时，用人单位应综合考虑国家法律法规和公司内部规章制度的双重约束。既要确保遵守国家关于带薪休假、病假待遇等方面的法律规定，又要根据公司实际情况和劳动合同约定，合理确定事假等其他类型假期的工资扣除方式。

综上所述，员工休假期间的工资计算与扣除是一个复杂而细致的问题。用人单位在处理时应确保既符合国家法律法规要求，又体现公司内部规章制度的合理性，以维护员工权益和企业利益的双赢局面。如果您有具体的休假和工资扣除情况需要咨询，建议查阅公司内部的规章制度或咨询专业的法律人士。