小区商铺在小区内开后门通常属于违规行为。这一行为的合法性需根据具体情况判断，但一般情况下，未经合法程序和相关同意擅自开后门，会违反相关法律法规和规定。以下是对此问题的详细分析：
违反规划设计：
- 小区规划设计图纸中若未包含商铺开后门的设计，私自开后门则改变了建筑原有规划结构，违反了《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定。此行为可能面临相关部门责令改正、恢复原状，甚至罚款、拆除等处罚。
破坏建筑结构安全：
- 开后门过程中若破坏了建筑的主体或承重结构，将严重威胁建筑安全，违反了《建设工程质量管理条例》关于建筑物结构安全保护的规定。建设单位或施工单位需承担相应的法律责任。
侵犯业主共有权益：
- 商铺开后门若占用公共通道、绿地等业主共有部分，将侵犯业主的共有权益，违反了《中华人民共和国民法典》关于建筑物区分所有权和业主共有的规定。业主有权要求商铺停止侵权行为，恢复原状。
违反物业管理规定：
- 商铺开后门若违反了物业服务合同中的管理秩序、房屋使用规范等约定，物业公司有权依据合同要求商铺整改，并可能面临违约责任。
然而，也存在一些特殊情况下开后门可能是合法的：
- 获得规划变更许可：商铺经营者需向当地规划部门提出申请，并获得规划变更批准及相关施工许可后，方可合法开后门。
- 取得相关权益人同意：若开后门不涉及改变规划和破坏结构安全，且获得了受影响的业主、业主委员会及物业管理公司的一致书面同意，此情况下开后门具有一定合法性。
综上所述，小区商铺在小区内开后门的行为需谨慎对待。在未经合法程序和相关同意的情况下，擅自开后门通常属于违规行为，并可能面临相应的法律后果。因此，建议商铺经营者在考虑开后门时，务必先咨询相关法律专业人士（如我这样的专业律师），确保行为的合法性，避免不必要的法律纠纷和经济损失。