商铺的产权40年到期后，并不会被无偿收回。这一结论是基于我国相关法律法规的规定以及实际操作流程得出的。

首先，根据《民法典》的相关规定，虽然它明确指出了住宅建设用地使用权期限届满会自动续期，但对于非住宅建设用地（如商铺所在土地）的使用权期限届满后的处理并未直接规定自动续期。然而，这并不意味着商铺产权到期后就会被无偿收回。

其次，《城市房地产管理法》为非住宅建设用地的续期提供了明确的法律依据。该法规定，土地使用年限届满时，土地使用者有权申请续期。为了确保续期的顺利进行，土地使用者应当至迟于届满前一年提出续期申请。除非基于社会公共利益的特殊原因需要收回土地，否则政府应当批准续期申请。一旦续期得到批准，土地使用者需要与政府重新签订土地使用权出让合同，并按照规定支付土地使用权出让金。

因此，在实际操作中，当商铺的40年产权即将到期时，产权人应当及时向当地的土地管理部门提出续期申请，并缴纳相应的土地出让金。如果政府批准了续期申请，产权人就可以继续拥有该商铺的产权，并合法地使用该商铺进行经营活动。

综上所述，商铺产权40年到期后并不会被无偿收回，只要产权人按照法律规定提出续期申请，并缴纳相应的费用，就可以继续拥有和使用该商铺。这一结论既符合法律法规的规定，也体现了对产权人合法权益的保护。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。