医院绩效考核方案的发文部门通常根据地域和医院级别有所不同。以北海市和北京市为例，可以为您具体说明：

在北海市，根据公开发布的信息，《北海市2023年城市公立医院绩效考核方案(试行)》是由北海市卫生健康委、财政局、人力资源和社会保障局以及医疗保障局联合发文的。这一方案适用于北海市的城市公立医院，并由这些部门共同负责考核工作的推进和实施。

而在北京市，二级公立医院的绩效考核工作实施方案则是由北京市卫生健康委员会和北京市中医管理局联合发布的。这一方案针对的是北京市的二级公立医院，并明确了考核的内容、目标以及组织实施的具体方式。

综上所述，医院绩效考核方案的发文部门一般涉及卫生健康委员会、财政局、人力资源和社会保障局、医疗保障局等相关政府部门。这些部门共同协作，以确保考核工作的科学性、公正性和有效性。如果您需要了解具体地区的医院绩效考核方案发文部门，建议查阅相关地区的官方文件或咨询当地卫生健康行政部门。