医院退休工资主要由国家发放。具体来说：
资金来源：医院退休工资，即养老金，其资金来源主要是社会保险基金，这个基金是由国家进行管理和运作的。单位（如医院）会为员工缴纳社会保险费，这些费用最终汇入社会保险基金，用于支付退休人员的养老金。
发放主体：当员工退休时，其养老金的发放主体并非原工作单位，而是社会保险经办机构，这些机构代表国家进行养老金的发放和管理。因此，从实际发放的角度来看，退休工资是由国家通过社会保险经办机构发放的。
法律依据：根据《中华人民共和国社会保险法》等相关法律法规，国家建立了基本养老保险制度，旨在为退休人员提供基本生活保障。这些法律法规明确规定了养老金的缴纳、管理和发放等相关事宜，确保了退休工资的合法性和稳定性。
综上所述，医院退休工资主要由国家发放，单位负责缴纳社会保险费，但具体的发放和管理工作则由社会保险经办机构代表国家进行。如果你对此有更多疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。