医院工资由医院自主确定并发放，而非财政直接发放。具体分析如下：

一. 医院工资的发放主体

1. 医院自主确定：根据《中华人民共和国劳动法》第四十七条，用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。医院作为用人单位，具有自主确定工资分配方式和水平的权利。
2. 非财政直接发放：虽然某些公立医院可能获得政府的财政补助，但这些补助通常用于医院的运营和发展，而非直接用于发放工资。工资的发放仍由医院根据自身经济状况和规定进行。

二. 工资发放的法律保障

1. 劳动合同约定：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着医院作为用人单位，必须按照与劳动者签订的劳动合同中的约定，按时足额支付工资。
2. 法律责任：如果医院未按照劳动合同约定或国家规定及时足额支付工资，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，或者由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬，并可能面临赔偿金等法律责任（依据《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条）。

综上所述，医院工资由医院自主确定并发放，而非财政直接发放。医院需根据自身经济状况和规定，以及与劳动者签订的劳动合同中的约定，按时足额支付工资。如有进一步需要，您可以继续咨询我。