土地增值税的扣除成本主要包括以下几个方面：

1. 取得土地使用权所支付的金额：

   • 这包括纳税人为获取土地使用权所支付的所有相关费用，如土地出让金、土地转让费等。

2. 开发土地和新建房及配套设施的成本：

   • 这部分成本涵盖了土地征用及拆迁补偿费、前期工程费（如规划、设计、可行性研究等费用）、建筑安装工程费、基础设施费（如道路、供水、供电、通讯等基础设施建设费用）、公共配套设施费（如学校、医院、公园等配套设施的建设费用）以及开发间接费用（如项目管理费、工程监理费等）。

3. 房地产开发费用：

   • 这包括与房地产开发项目直接相关的销售费用、管理费用和财务费用。其中，财务费用中的利息支出，如果能够按转让房地产项目计算分摊并提供金融机构证明，允许据实扣除，但最高不得超过按商业银行同类同期贷款利率计算的金额。其他房地产开发费用，则按取得土地使用权所支付的金额与开发土地和新建房及配套设施的成本之和的5%以内（部分地区为10%以内，具体根据当地政策确定）计算扣除。

4. 旧房及建筑物的评估价格：

   • 如果转让的是旧房及建筑物，其评估价格是根据政府批准设立的房地产评估机构评定的重置成本价乘以成新度折扣率后的价格来确定的，这部分价格可以作为扣除项目。

5. 与转让房地产有关的税金：

   • 这包括在转让房地产过程中缴纳的营业税（营改增后为增值税）、城市维护建设税、印花税以及教育费附加等税金，这些税金可以作为扣除项目。

6. 财政部规定的其他扣除项目：

   • 例如，对于从事房地产开发的纳税人，可以按上述第1至第2项规定计算的金额之和加计20%的扣除。这是针对房地产开发企业的特殊扣除政策。

此外，还有一些特殊规定需要注意：

• 土地增值税扣除项目涉及的增值税进项税额，如果允许在销项税额中计算抵扣，则不计入扣除项目；如果不允许在销项税额中计算抵扣，则可以计入扣除项目。
• 对于一些特殊支出，如财政补贴后的土地成本、装修费用等，是否能够计入加计20%的基数，各地政策可能有所不同，需要具体咨询当地税务机关。

总的来说，土地增值税的扣除成本涉及多个方面，包括土地使用权取得成本、开发成本、房地产开发费用、旧房及建筑物评估价格、相关税金以及其他扣除项目。在计算扣除成本时，需要仔细核对各项费用，并确保符合相关政策规定。如有任何疑问或不确定之处，建议及时咨询当地税务机关以获取准确解答。