在成本价卖房子时，土地增值税的计算涉及多个步骤和因素，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

一、了解土地增值税的基本概念

土地增值税是对转让国有土地使用权、地上建筑物及其附着物并取得收入的单位和个人，就其转让房地产所取得的增值额征收的一种税。因此，在成本价卖房时，如果产生了增值额，就需要缴纳土地增值税。

二、确定应税收入

应税收入是转让房地产所取得的全部收入，包括货币收入、实物收入和其他收入。在成本价卖房的情况下，应税收入就是卖房所得的款项。

三、计算扣除项目金额

扣除项目金额是计算增值额的基础，它包括以下几个方面：

1. 取得土地使用权所支付的金额：这包括购买土地使用权时支付的地价款、契税以及按国家统一规定交纳的有关费用。

2. 房地产开发成本：对于旧房及建筑物，评估价格由政府批准设立的房地产评估机构评定，并经当地税务机关确认。计算公式通常为重置成本价乘以成新度折扣率。

3. 房地产开发费用：如果能够提供金融机构证明，则财务费用中的利息支出可以据实扣除，但最高不能超过按商业银行同类同期贷款利率计算的金额。其他费用则按取得土地使用权所支付的金额与房地产开发成本之和的5%以内计算扣除。如果不能提供金融机构证明，则按上述两项金额之和的10%以内计算扣除。

4. 与转让房地产有关的税金：这包括城市维护建设税、印花税、教育费附加等。

5. 财政部规定的其他扣除项目：对于从事房地产开发的纳税人，还可以按取得土地使用权所支付的金额与房地产开发成本之和，加计20%的扣除。

四、计算增值额与增值率

• 增值额 = 转让房地产收入 - 扣除项目金额
• 增值率 = 增值额 ÷ 扣除项目金额 × 100%

五、确定税率与计算应纳税额

土地增值税实行四级超率累进税率，根据增值率的不同，适用不同的税率和速算扣除系数：

1. 增值率未超过50%的部分，税率为30%，速算扣除系数为0；
2. 增值率超过50%、未超过100%的部分，税率为40%，速算扣除系数为5%；
3. 增值率超过100%、未超过200%的部分，税率为50%，速算扣除系数为15%；
4. 增值率超过200%的部分，税率为60%，速算扣除系数为35%。

应纳税额 = 增值额 × 适用税率 - 扣除项目金额 × 速算扣除系数（如有）

六、注意事项与优惠政策

• 在进行土地增值税计算时，应确保所有数据的准确性和完整性。
• 对于个人销售住房，特别是居民个人拥有的普通住宅，在转让时可能享受暂免征收土地增值税的优惠政策。具体认定标准需根据各省、自治区、直辖市人民政府的规定执行。

综上所述，成本价卖房子时土地增值税的计算是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多个因素。建议在进行相关操作前咨询专业的税务人员或律师，以确保计算的准确性和合规性。