回迁房房产证和商品房房产证之间确实存在一些不同，主要体现在以下几个方面：

1. 土地性质不同：

   • 回迁房一般是划拨土地，其出让金由政府减免，因此价格相对较低。
   • 商品房通常是出让土地，需要缴纳出让金，土地性质更灵活，土地使用年限一般为70年。

2. 产权限制不同：

   • 回迁房在取得房产证一定年限内（通常为5年），可能限制上市交易，以保障回迁户的权益。
   • 商品房在取得房产证后即可自由上市交易，产权流动性较强。

3. 税费不同：

   • 由于产权性质和交易限制的差异，回迁房在交易时可能涉及的土地出让金等相关税费与商品房不同。

4. 办证流程不同：

   • 回迁房的办证流程可能相对复杂，需要协调多个部门和回迁户等。
   • 商品房的办证流程一般较为规范和标准化。

5. 产权性质与交易价格：

   • 回迁房的产权性质可能为经济适用房等，其价格通常较低，受建设成本和交易限制等因素影响。
   • 商品房的产权性质通常为普通住宅产权，价格受市场供求等因素影响，波动相对较大。

综上所述，回迁房房产证和商品房房产证在土地性质、产权限制、税费、办证流程以及产权性质与交易价格等方面均存在显著差异。这些差异主要源于两者的建设背景、政策目的以及市场定位的不同。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。