买的商品房但房产证是回迁房性质，这种情况是否合法需分情况讨论：
一、合法情形
产权性质明确且合规：
- 回迁房本身是合法的，它是因城市更新等项目对被拆迁人进行安置所建的房屋，只要相关程序合规，产权清晰，即为合法。若您购买的“商品房”实际为回迁房，但开发商在销售时已明确告知房屋性质，且该房屋已通过合法程序取得房产证，那么这种情况是合法的。
- 法律依据：回迁房的建设基于合法的拆迁安置协议，只要符合土地管理、城乡规划、房地产开发等相关法律法规要求，就具备合法性。
合同约定清晰：
- 如果您在购买时与开发商签订的购房合同中明确约定了房屋性质为回迁房，且您对此表示接受，那么这种情况也是合法的。关键在于合同中的约定是否明确、双方是否自愿。
二、不合法情形
开发商欺诈：
- 如果开发商在销售时故意隐瞒房屋性质，将回迁房当作商品房销售，且未在合同中明确告知，那么这种情况可能构成欺诈。您有权要求开发商承担违约责任，甚至解除合同。
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
房产证办理不合规：
- 如果回迁房的房产证办理过程中存在违规行为，如未通过合法程序取得、房产证上的信息与实际不符等，那么这种情况也是不合法的。您有权要求相关部门进行调查并纠正。
三、建议与措施
核查合同与房产证：
- 建议您首先核查购房合同中的条款，确认开发商是否明确告知了房屋性质。同时，仔细核对房产证上的信息，确保与实际相符。
与开发商沟通：
- 如果发现存在问题，建议您及时与开发商沟通，要求其给出合理解释并采取补救措施。如果开发商拒绝配合或无法解决问题，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
寻求法律帮助：
- 如果您对房屋性质或房产证办理过程存在疑虑，或者与开发商沟通无果，建议您及时咨询专业律师（比如我），以便更好地了解自己的权益并采取相应的法律措施。
总结来说，买的商品房但房产证是回迁房性质是否合法，取决于房屋性质是否明确、合同约定是否清晰以及房产证办理是否合规。如果您对此存在疑虑或发现问题，建议及时采取措施维护自己的权益。