针对机关干部因公长期借用公款不还的问题，首先我们需要明确的是，这种行为是违反相关纪律规定的。根据提供的参考信息，我们可以对此类情况进行如下处理：

一、追还所欠公款

对于个人借用公款超过六个月不还的情况，应首先追还所欠的公款。这是处理此类问题的首要步骤，也是恢复公款正常使用和保持财政纪律的重要措施。

二、给予相应的纪律处分

1. 情节较轻：如果个人借用公款超过规定时间但能还而不还，且没有其他严重情节，可能会给予警告或严重警告处分。
2. 情节较重：如果借用公款时间较长，或者存在其他较为严重的违规情况，如进行营利活动等，可能会给予撤销党内职务等更严重的处分。
3. 情节严重：如果借用公款进行非法活动，如赌博、走私等，将会从重或加重处理，可能包括撤销党内职务、留党察看甚至更严厉的处分。

三、特殊情况考虑

值得注意的是，如果个人确因生活困难到期无力归还公款，可能会在处理时给予一定的考虑和宽限。但这并不意味着可以无限制地借用公款不还，只是在特定情况下的特殊处理。

四、加强管理和预防

除了对已经发生的问题进行处理外，更重要的是加强公款的管理和预防类似问题的再次发生。这包括完善公款借用和报销的制度、加强财务监督、提高干部的财经纪律意识等措施。

综上所述，对于机关干部因公长期借用公款不还的问题，应严格按照相关规定进行处理，既要追还公款，又要给予相应的纪律处分，并加强管理和预防工作，以确保公款的合规使用和维护财政纪律的严肃性。