当灵活就业人员转为单位缴纳社保时，需要按照一定流程办理相关手续，以确保社保缴纳的顺利过渡。以下是对这一流程的详细解答：
首先，明确一点，根据法律规定，为职工依法缴纳社会保险费是用人单位的法定义务。因此，当灵活就业人员入职新单位后，就不能再继续以灵活就业人员身份参保了，而是需要由单位为其办理社保参保手续。
具体办理流程如下：
个人先办停缴：灵活就业人员需要先前往当地社保部门或相关机构，办理灵活就业停止缴费手续。这一步是退出灵活就业参保方式的关键步骤。
单位再办就业参保：在个人完成停缴手续后，用人单位就可以按照在职职工的方式，为新员工办理就业参保手续了。这通常包括填写相关表格、提交必要材料，并缴纳相应的社保费用。
此外，关于灵活就业转企业职工参保后，原先按灵活就业人员缴纳的养老保险费是否会清零的问题，可以放心的是，这些费用不会清零。无论是灵活就业转企业职工缴费，还是失业中断缴费，前后的缴费年限和养老保险个人账户储存额都是累计计算的，确保了个人的社保权益不受损失。
总的来说，灵活就业人员转为单位缴纳社保是一个相对简单但重要的过程，需要个人和单位共同配合完成。通过遵循上述流程，可以确保社保缴纳的顺利过渡，保障个人的社保权益。