发现员工犯罪后，单位应采取一系列严谨且合法的处理措施来确保单位权益和社会秩序得到维护。以下是对此问题的详细解答：
一、初步调查与报案
内部初步调查：
- 单位应首先进行内部初步调查，确保调查过程的合法性和合规性，同时避免侵犯员工的合法权益。
- 收集并固定与犯罪行为相关的证据材料，为后续处理提供有力支持。
向公安机关报案：
- 一旦确认员工可能存在犯罪行为，单位有义务及时向公安机关报案，并配合其调查工作。
- 提供所掌握的证据和信息，协助公安机关开展侦查工作，有效防止犯罪行为进一步恶化。
二、劳动关系处理
暂停工作：
- 为防止员工继续实施损害行为或干扰调查，单位可按照法定程序暂停其工作，并明确告知原因和期限。
解除劳动关系：
- 若员工犯罪行为严重违反单位规章制度（且该规章制度需经民主程序制定并已公示），单位可依据《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
- 即使规章制度未明确规定，但员工被依法追究刑事责任的，单位同样有权依据《劳动合同法》解除劳动合同，无需支付经济补偿。
三、法律追责与索赔
法律追责：
- 对于直接负责的主管人员和其他直接责任人员，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，应依法追究其刑事责任，并追缴违法所得。
索赔：
- 倘若员工的犯罪行为给单位带来了经济损失，单位可通过民事诉讼的法律途径，要求员工进行赔偿，以挽回损失。
四、内部整改与风险防范
内部整改：
- 单位应进行内部调查和整改，发现和修正管理漏洞，建立健全内部控制和监督机制。
- 加强员工法制教育，提高员工的法律意识和道德水平，预防类似事件的再次发生。
风险评估与防范：
- 全面评估员工犯罪行为可能带来的法律风险、经济损失和声誉损害。
- 采取相应的风险防范和应对措施，确保单位的稳定和发展。
五、其他事项处理
通知相关方：
- 单位应及时将员工犯罪及解除劳动关系等情况通知工会，并听取其意见。
- 根据实际情况决定是否向合作伙伴、客户等相关方通报情况，以维护单位的声誉和合作关系。
员工档案处理：
- 按规定对员工的人事档案进行相应处理，记录解除劳动关系的情况和犯罪事实等。
综上所述，单位在处理员工犯罪行为时，应严格遵循法律法规和单位规章制度，确保处理过程的合法性、公正性和有效性。同时，通过加强内部管理和员工教育，预防类似事件的再次发生，维护单位的稳定和发展。