在施工单位发生施工事故时，由施工单位负责上报事故。这一结论基于以下法律条文和律师见解：

1. 法律依据：

   • 根据《建设工程安全生产管理条例》第五十条，施工单位发生生产安全事故，应当按照国家有关伤亡事故报告和调查处理的规定，及时、如实地向负责安全生产监督管理的部门、建设行政主管部门或者其他有关部门报告。这一条款明确规定了施工单位在发生安全事故后的上报责任。

2. 律师见解：

   • 在实施总承包的建设工程中，若发生事故，事故的上报责任由总承包单位承担。总承包单位作为项目的统筹管理者，掌握着工程建设的各方面情况，因此有责任及时、准确地向有关部门报告事故信息，以便迅速启动应急救援程序，最大限度地降低事故损失。
   • 对于非总承包的施工项目，施工单位同样承担事故上报的责任。事故发生后，现场有关人员应立即向本单位负责人报告，单位负责人则需在规定时间内向相关部门进行报告。

综上所述，无论是总承包项目还是非总承包项目，施工单位在发生施工事故后，都负有及时、如实上报事故的责任。这一责任不仅是对法律法规的遵守，也是对项目安全管理和应急救援工作的负责任态度。如有任何关于施工事故上报或处理的问题，请直接向我咨询。