当公司没有为员工代扣代缴个人所得税时，员工是否需要自行补交税款，这主要取决于员工的综合所得是否达到了纳税的标准。以下是对这一问题的详细解答：

一、公司代扣代缴义务与员工纳税义务

根据《个人所得税法》的相关规定，公司作为扣缴义务人，有义务为员工代扣代缴个人所得税。但这并不意味着员工的纳税义务就此免除。即使公司未能履行这一义务，员工在取得应税收入并达到纳税标准时，仍然需要依法承担纳税责任。

二、员工综合所得与纳税判断

1. 无需纳税的情况：

   • 如果员工的综合所得年收入未超过12万元，或者年度汇算时需要补税的金额不超过400元，并且符合其他免于汇算清缴的情形，那么员工无需进行汇算清缴，也就无需补交税款。

2. 需要纳税的情况：

   • 如果员工的综合所得达到了纳税标准，那么员工需要在年度汇算期内，通过个人所得税APP或其他官方渠道办理综合所得年度汇算。在计算出应纳税额后，与已预缴的税额进行对比，如果仍有差额，则需要完成补税。

三、补税流程与注意事项

1. 自行补缴：员工应按照规定的时间和方式，自行通过官方渠道完成税款的补缴。

2. 滞纳金：如果员工未能及时补交税款，还需要从应交税款之日起缴纳滞纳金。这是对员工未能按时履行纳税义务的一种经济处罚。

3. 法律风险：虽然纳税的主体是员工，但公司未履行代扣代缴义务也是违法的。税务机关不仅会向员工追缴税款，还会对公司进行处罚。因此，员工在发现公司未代扣代缴个税时，应及时与公司沟通并要求其履行义务。

四、应对措施与建议

1. 与公司沟通：员工应首先与公司沟通，了解未代扣代缴个税的具体原因，并要求公司尽快履行代扣代缴义务。

2. 专业咨询：如果员工对自己的纳税情况不确定，或者不知道如何操作，可以寻求专业律师或会计师的帮助，以确保准确履行纳税义务并预防未来可能出现的风险。

3. 向税务机关反映：如果与公司沟通无果，员工可以向税务机关反映情况，由税务机关进行调查处理。

综上所述，当公司没有为员工代扣代缴个人所得税时，员工应根据自己的综合所得情况判断是否需要自行补交税款，并及时采取相应措施确保合法合规地履行纳税义务。同时，员工也应关注公司是否依法履行了代扣代缴义务，以维护自身权益并避免潜在的法律风险。