针对您提出的“工伤基金报销后有自费的医疗费怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，当工伤治疗费用中存在应由工伤保险基金支付的部分时，这部分费用通常是由社会保险经办机构审核后与医疗机构直接结算的。这意味着，在理想情况下，工伤职工无需自己垫付这部分费用，也无需亲自去办理报销手续。然而，在实际操作中，可能会因为各种原因导致部分医疗费用需要工伤职工自费支付。

对于这部分自费的医疗费用，您可以根据所在地的具体规定和政策来选择相应的报销方式。一般来说，有以下几种可能的途径：

1. 手工报销：

   • 如果您所在地的社保机构提供了手工报销的服务，您可以按照规定的流程和要求，准备好相关的医疗费用票据、诊断证明、治疗记录等材料，到社保机构进行手工报销申请。
   • 手工报销的具体流程可能因地区而异，建议您咨询当地的社保机构或相关部门，了解具体的报销要求和流程。

2. 线上报销申请：

   • 部分地区可能已经实现了线上报销申请的功能，您可以通过当地的社保APP、微信公众号或其他官方平台，按照提示填写报销申请信息，并上传相关的医疗费用票据和材料。
   • 线上报销申请通常更加便捷，可以节省您的时间和精力。同样，具体的申请流程和所需材料可能因地区而异，建议您提前了解并准备好。

3. 咨询用人单位：

   • 如果您在报销过程中遇到任何问题或困难，也可以咨询您的用人单位或人事部门。他们可能能够为您提供更具体的指导和帮助，或者协助您与社保机构进行沟通。

最后，需要提醒的是，不同地区的工伤保险政策和报销流程可能存在差异。因此，在办理报销手续前，请务必了解清楚您所在地的具体规定和要求，以确保您的报销申请能够顺利进行并得到应有的补偿。